​Les CdG sont subdivisées en sous-commissions permanentes, auxquelles sont attribués les sept départements fédéraux, la Chancellerie fédérale ainsi que les tribunaux fédéraux. En général, ce sont les sous-commissions qui effectuent, sur mandat des CdG, le travail d'enquête à proprement parler (par ex. auditions). Elles font rapport à la commission plénière, qui est l'organe de décision. Il revient notamment aux commissions plénières d'adopter les rapports et recommandations aux autorités. Parfois, des groupes de travail ad hoc sont formés provisoirement pour examiner un objet donné.

sous-commissions du Conseil national

Sous-commission DFAE / DDPS

Sous-commission DFF / DEFR

Sous-commission DFI / DETEC

Sous-commission DFJP / ChF

Sous-commission Tribunaux / MPC

Sous-commissions du Conseil des États

Sous-commission DFAE / DDPS

Sous-commission DFF / DEFR

Sous-commission DFI / DETEC

Sous-commission DFJP / ChF

Sous-commission Tribunaux / MPC