Die PVK arbeitet sich in das Thema ein und nimmt mit den betroffenen Bundesstellen Kontakt auf. Sie erstellt eine Projektskizze, die in der Regel mehrere Untersuchungsvorschläge enthält. Die zuständige Subkommission der GPK entscheidet, welche Vorschläge umgesetzt werden. Ab diesem Zeitpunkt bis zur Zustellung des Evaluationsberichts an die Subkommission arbeitet die PVK unabhängig.